系統排列的運作，建立在對生命系統與人自身感知能力的探索上。當我們運用代表者進入一個系統時，代表者會透過自己的身體與感受，接收到這個系統當中的一些資訊，再把當下感受到的狀態呈現出來。 這個過程裡，代表者的意識通常是清楚的。他知道自己正在參與排列，也知道自己正在感受什麼。身體所出現的感覺、情緒、動作或變化，可以成為我們觀察系統的一種途徑，幫助我們看見原本不容易察覺的關係與現象。 因此，系統排列需要保持清醒與清晰。當排列被加入通靈、附身等怪力亂神的解釋，參與者很容易對這個自然的感知現象產生誤解，甚至因此產生恐懼。原本可以透過排列去理解生命、看見關係與探索問題的過程，也可能因此變得混亂。 這樣的帶領方式對排列師本身同樣存在影響。當一個排列師習慣用神秘化的方式解釋現象，久而久之，自己也可能失去對現場資訊的客觀判斷。同時，參與者對排列師具有信任，排列師的一句話、一個判斷，都可能對個案產生很大的影響。當帶領者把自己放在具有特殊能力或巨大權威的位置，個案很容易把自己的判斷交出去，開始依賴排列師告訴自己答案。 這時候，個案原本可以透過排列看見自己的生命狀態，慢慢失

在一場關於系統排列的討論裡，有人提出了一個常見的疑問：站在代表位置的人，為什麼有時會自然出現某種情緒、想法，甚至連身體動作都會變得很貼近他所代表的角色。同時，也有人擔心，擔任代表會不會把別人的情緒或議題「帶回自己身上」，進而對自己造成影響。 回應這些疑問時，老師先從系統排列的早期發展談起。大約在幾十年前，美國一些心理學家在進行家庭會談時，嘗試讓家人一起討論生活中遇到的問題。有些情況下，家庭中的某個成員因為無法到場，研究者便安排其他人暫時代替他的位置參與討論。 令人意外的是，這些代為出席的人，在談話過程中說出的語句與表達方式，往往帶有強烈的個人特徵，有些甚至接近當事人平常的說話習慣，這樣的現象引起了研究者的注意。 隨著這類經驗不斷累積，研究者開始設計更多實驗，試著理解這種現象的來源。在後續的研究中，也出現過類似的觀察：當代表被安排在不同的空間進行同一個家庭系統的演示時，他們在情緒表達上呈現出某種一致的方向，例如扮演父親的人會出現憤怒的狀態，有人會握緊拳頭，也有人會有更強烈的肢體反應；扮演母親的人則可能出現悲傷的情緒，有的安靜落淚，有的哭泣程度更明顯